Molibden bitkilerin beslenmesinde de önemli olup bazı enzimlerde yer alır.
Canlı hücrelerinde eser miktarda bulunan molibden, bitkiler için gerekli olan bir elementtir. Ayrıca baklagillerde bakterilerin azot bağlama sürecinde katalizör işlevi görür. Molibden trioksit ve sodyum molibdat (Na2MoO4) bitkilerin beslenmesinde eser miktarda kullanılır
Tarım sektöründe yaygın olarak kullanılmaktadır.Özellikle, brokoli ve karnabahar, yetişmesi için gerekli olan molibden eksiklini karşılamakta yararlanılır.